1、一般治疗：脱离变应原是最为理想有效的治疗手段。应尽量避免与可能的变应原接触，如清除房间的破布及毛毯，注意床上卫生，使用杀虫剂消灭房间的虫螨，在花粉传播季节避免接触草地、树花等，停戴或更换优质的接触镜与护理液。
2、药物治疗：
（1）抗组胺药：肥大细胞脱出来的小颗粒中很重要的一种是组胺，这类药就是拮抗组胺这条途径的，有明显的止痒作用，通常局部使用，代表药物为埃美丁（依美斯汀）。如果有眼外症状，可以口服使用，不过其效果不如局部用药。常用口服药物有开瑞坦（氯雷他定）、异丙嗪等。
（2）肥大细胞稳定剂：常用的有色甘酸钠眼液。肥大细胞稳定剂的总体治疗效果虽不及抗组胺药，但其对抑制流泪似乎更有效。最好在接触过敏原之前使用。
（3）非甾体类抗炎药：在过敏性疾病发作的急性阶段及间歇阶段均可使用，对缓解眼痒、结膜充血、流泪等眼部症状及体征均显示出一定的治疗效果，它还可以减少激素的使用剂量，常用的有普拉洛芬眼液及双氯芬酸钠眼液等。
（4）糖皮质激素：严重的过敏性结膜炎使用其他药物治疗无效时才考虑使用，且使用时间不宜太长，以免引起白内障、青光眼、真菌感染及角膜上皮愈合延迟等并发症。常用的有典必殊眼液及氟米龙等。
（5）免疫抑制剂：主要有环孢霉素A及FK506对于一些严重的需要使用激素的春季角结膜炎病例，局部应用2%的环孢霉素A可以很快控制局部炎症及减少激素的使用量。
3、冷敷疗法：此法主要用于春季角结膜炎。冷敷治疗用冷冻过的毛巾敷在双眼睑上，持续1到2分钟。冷敷疗法一天可以重复数次，尤其对小儿可减缓症状。
4、心理治疗：眼过敏性疾病是一种急性或慢性的反复发作性疾病，彻底根治非常困难。因此对一些患者造成较大的心理压力。特别是一些春季角结膜炎的患儿，可能会出现一定的心理障碍，应加以注意。
5、日常调理：过敏是过敏体质接触过敏原后发病所致，建议通过口服乐亦康益生菌进行过敏体质的改善。